RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 FOLR3P41439 243 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PLAURQ03405 335 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NPTX1Q15818 432 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR22Q8IZ63 422 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 OR4C3Q8NH37 302 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 POLE3Q9NRF9 147 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 U3KQV3 271 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 OR6C76A6NM76 312 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.25■□□□□ 0.83
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PACSIN3-209ENST00000532457 TPST2O60704 377 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 GUSBP08236 651 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKAR1BP31321 381 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DLSTP36957 453 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DTNAQ9Y4J8 743 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 GNGT2O14610 69 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 CELA2AP08217 269 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 COX6A1P12074 109 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IL7RP16871 459 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP11P24347 488 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 AQP4P55087 323 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNC4Q03721 635 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TGIF1Q15583 401 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 HSDL2Q6YN16 418 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 CBR4Q8N4T8 237 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IFT52Q9Y366 437 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IFNW1P05000 195 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QTNF9P0C862 333 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKACGP22612 351 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DCTP40126 519 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF7P61962 342 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXC5Q00444 222 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 CLN3Q13286 438 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DNASE1L3Q13609 305 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 LAPTM4AQ15012 233 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NRF1Q16656 503 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 VMP1Q96GC9 406 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGDIGQ99819 225 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 RHCGQ9UBD6 479 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TESMINQ9Y4I5 508 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PCSK5Q92824 1860 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 C7orf72A4D263 438 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 TO15178 435 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 IL33O95760 270 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 THBS1P07996 1170 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF23P17027 643 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF605Q86T29 641 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PMM1Q92871 262 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC42Q9Y546 428 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 SYT5O00445 386 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 NID1P14543 1247 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP6V1C1P21283 382 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 RRM2P31350 389 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF141Q15928 474 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 DECR1Q16698 335 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-209ENST00000532457 ACER3Q9NUN7 267 aa20.22■□□□□ 0.83
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