RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494333.1

RIF1-211, Transcript of replication timing regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RIF1, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1-211ENST00000494333 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 Q8TCH9 128 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 KLHL29Q96CT2 875 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 CCDC126Q96EE4 140 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 APIPQ96GX9 242 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 KCNA7Q96RP8 456 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 SMC6Q96SB8 1091 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 DOHHQ9BU89 302 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ACPTQ9BZG2 426 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 EXO5Q9H790 373 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 PROK2Q9HC23 129 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 EMCNQ9ULC0 261 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.4□□□□□ -1.22
RIF1-211ENST00000494333 MAST4O15021 2626 aa7.4□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NOTCH2Q04721 2471 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 A0A1B0GVC2 190 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 C19orf84I3L1E1 186 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 BCKDKO14874 412 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ATP1B1P05026 303 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 IL3P08700 152 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MYL2P10916 166 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 COX6B1P14854 86 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NAGLUP54802 743 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FOXA1P55317 472 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 FBXW4P57775 412 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 DUSP2Q05923 314 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MGAT2Q10469 447 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 RPS6KA2Q15349 733 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CCDC153Q494R4 210 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CFAP157Q5JU67 520 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PRR22Q8IZ63 422 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CCDC63Q8NA47 563 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 RND1Q92730 232 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SARAFQ96BY9 339 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZNF681Q96N22 645 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 HEY2Q9UBP5 337 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ZNF639Q9UID6 485 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CFL2Q9Y281 166 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CACNA1DQ01668 2161 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 COPEO14579 308 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PCDH7O60245 1069 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 PLIN3O60664 434 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 HCN1O60741 890 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CRCPO75575 148 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 TRAPPC6AO75865 159 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 SNX4O95219 450 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 CPA3P15088 417 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 NAGAP17050 411 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 KRT4P19013 534 aa7.38□□□□□ -1.23
RIF1-211ENST00000494333 GPX3P22352 226 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms