RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160		H0YL77	283 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CASK	O14936	926 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ALOX15B	O15296	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	NEBL	O76041	1014 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	NDUFB10	O96000	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CGA	P01215	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FCER2	P06734	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RALB	P11234	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CD1D	P15813	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RGS19	P49795	217 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SGSH	P51688	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CDH4	P55283	916 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SRPX	P78539	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	NAAA	Q02083	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	BST1	Q10588	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SYPL1	Q16563	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PEX13	Q92968	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	VGLL1	Q99990	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PANK3	Q9H999	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	AFF2	P51816	1311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160		A8MXK9	166 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160		E9PQ18	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FBP2	O00757	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	EI24	O14681	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF749	O43361	778 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TSPAN2	O60636	221 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	DNAJB6	O75190	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SERPINB2	P05120	415 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FH	P07954	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	MAGEA1	P43355	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PLA2G16	P53816	162 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PEX3	P56589	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	IL9R	Q01113	521 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TGM3	Q08188	693 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CDKN3	Q16667	212 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCL20-204	ENST00000489160	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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