RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488741.5

CREM-238, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2 BASIC

Gene CREM, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-238	ENST00000488741	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		A0A1B0GUH1	482 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		E7EQ34	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		H7C4K7	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		L7N2F9	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	AIP	O00170	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ABCD4	O14678	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZNF749	O43361	778 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RNF13	O43567	381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PI15	O43692	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SSNA1	O43805	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PEX14	O75381	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	STX11	O75558	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	STC2	O76061	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	UBXN7	O94888	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	EOMES	O95936	686 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	HMGN1	P05114	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FGF2	P09038	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CPN1	P15169	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PPP3CB	P16298	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CEL	P19835	753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RAB6A	P20340	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	MMP11	P24347	488 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SERPINA4	P29622	427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	HTR1F	P30939	366 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	NNMT	P40261	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	STAT5A	P42229	794 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CBX5	P45973	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	BLVRA	P53004	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CDH11	P55287	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	AP3S2	P59780	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RAP2B	P61225	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TSPAN5	P62079	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GPR17	Q13304	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	NAE1	Q13564	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GNA13	Q14344	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	KRT33B	Q14525	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PTPRR	Q15256	657 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RNF180	Q86T96	592 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	STPG2	Q8N412	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TTL	Q8NG68	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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