RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469856.1

ABCC10-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 10, human

TSL 3

Gene ABCC10, Length 285 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC10-208	ENST00000469856	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856		K7ESF4	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	BRINP1	O60477	761 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	FPR3	P25089	353 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GABRA3	P34903	492 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GIPR	P48546	466 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GPLD1	P80108	840 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CDK5	Q00535	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	STX4	Q12846	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	NR1D2	Q14995	579 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	KMT5C	Q86Y97	462 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	RIT1	Q92963	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	DGAT2	Q96PD7	388 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	FRY	Q5TBA9	3013 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SNTN	A6NMZ2	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	DUX1	O43812	170 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PRAMEF2	O60811	474 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CT62	P0C5K7	136 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MSL3P1	P0C860	447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CDK4	P11802	303 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	S1PR1	P21453	382 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	BCKDHB	P21953	392 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	STT3A	P46977	705 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	OMP	P47874	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PCYT1A	P49585	367 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC13A2	Q13183	592 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	NCF4	Q15080	339 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CTF1	Q16619	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	C11orf74	Q86VG3	221 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	OSTF1	Q92882	214 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM131	Q92545	1883 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TPST2	O60704	377 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SOX14	O95416	240 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	STS	P08842	583 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GLB1	P16278	677 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	TNNI3	P19429	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	ZNF136	P52737	540 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GFER	P55789	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GINS1	Q14691	196 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR68	Q15743	365 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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