RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP27Q9H306 513 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 XKR8Q9H6D3 395 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGF22Q9HCT0 170 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 LHX9Q9NQ69 397 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 GALNT8Q9NY28 637 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0G2JN53 185 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 BTN3A3O00478 584 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 LATO43561 262 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL18O94889 574 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED26O95402 600 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB36O95755 333 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 SFTPCP11686 197 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 CHMP24386 653 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD40LGP29965 261 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 LIM2P55344 173 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 ST3GAL4Q11206 333 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCF4Q15080 339 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED22Q15528 200 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCEA2Q15560 299 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ISXQ2M1V0 245 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNLSQ5VYX0 342 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL35Q6PF15 583 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM107Q6UX40 140 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP53Q70EK8 1073 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAQR7Q86WK9 346 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP21Q8N119 569 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A45Q8N413 288 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCFD2Q8NI22 146 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB8BQ92930 207 aa5.89□□□□□ -1.47
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SHQ1P1-201ENST00000437111 LGALS12Q96DT0 336 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM80Q96HE8 168 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR7D2Q96RA2 312 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYRM4Q9HD34 91 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FZD3Q9NPG1 666 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.89□□□□□ -1.47
SHQ1P1-201ENST00000437111 GIN1Q9NXP7 522 aa5.89□□□□□ -1.47
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