RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 FXNQ16595 210 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PDZK1Q5T2W1 519 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 NUP54Q7Z3B4 507 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MDGA2Q7Z553 956 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 LRFN1Q9P244 771 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SNX13Q9Y5W8 968 aa25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 UGT2B17O75795 530 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ITGB2P05107 769 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CCL3P10147 92 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CRYBA2P53672 197 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ARG2P78540 354 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MS4A2Q01362 244 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GLYATQ6IB77 296 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 RTL4Q6ZR62 310 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 OR5H15A6NDH6 313 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PDGFAP04085 211 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GUSBP08236 651 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 EVI2BP34910 448 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ATP12AP54707 1039 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 OR1C1Q15619 314 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PRAMEF20Q5VT98 475 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SPINK14Q6IE38 97 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 APOOLQ6UXV4 268 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC80Q76M96 950 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 VRK2Q86Y07 508 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GATSQ8NAP1 163 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SPPL2AQ8TCT8 520 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GRHL3Q8TE85 626 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TTC9Q92623 222 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 FAM162AQ96A26 154 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TAMM41Q96BW9 452 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TMCO6Q96DC7 493 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 UBQLN4Q9NRR5 601 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa25.87■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 AGAP5A6NIR3 686 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 K7EM74 188 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TP53I11O14683 189 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SCO2O43819 266 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ETS2P15036 469 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ATP6V1B2P21281 511 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 LCN1P31025 176 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 IGFL2Q6UWQ7 119 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CYP2R1Q6VVX0 501 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 KRT73Q86Y46 540 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 POGLUT1Q8NBL1 392 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ASB9Q96DX5 294 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF607Q96SK3 696 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 RTN4RQ9BZR6 473 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 RNF32Q9H0A6 362 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SH2D2AQ9NP31 389 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PCNX3Q9H6A9 2034 aa25.86■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN24A6NM45 220 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 C17orf51A8MQB3 221 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 G3V3Y1 287 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 M0QX08 132 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 FADS1O60427 444 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 NEURL1O76050 574 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 TBXA2RP21731 343 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 KDELR2P33947 212 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CD97P48960 835 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 DMTNQ08495 405 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF141Q15928 474 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 LINC00303Q3SY05 128 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PEX5LQ8IYB4 626 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SMYD1Q8NB12 490 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 OR52P1PQ8NH57 321 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PAQR8Q8TEZ7 354 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 HES7Q9BYE0 225 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GALNT9Q9HCQ5 603 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 HEATR5AQ86XA9 2040 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 SCDO00767 359 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 GMNNO75496 209 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 PDE9AO76083 593 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 FAM87AP0C7U9 286 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 HPGDP15428 266 aa25.85■■□□□ 1.73
GIPC1-202ENST00000393028 AP1ARQ63HQ0 302 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms