RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM225BP0DP42 221 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MS4A2Q01362 244 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TGFBR3Q03167 851 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ARL6IP1Q15041 203 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EID2Q8N6I1 236 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ARRDC3Q96B67 414 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ABCG5Q9H222 651 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 H0YGG7 62 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 M0R129 80 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TSPAN9O75954 239 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAS1P04201 325 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GKN3PP0CG01 181 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ADRA1AP35348 466 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 Q8N402 240 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF709Q8N972 641 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.72□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 A6NIZ1 184 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CLCA1A8K7I4 914 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 AMY2BP19961 511 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RAP1BP61224 184 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RAP1AP62834 184 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DCST2Q5T1A1 773 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 XKRXQ6PP77 449 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FRS2Q8WU20 508 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FAM46BQ96A09 425 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TCTN2Q96GX1 697 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KLHL15Q96M94 604 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC6A7Q99884 636 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ICKQ9UPZ9 632 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF175Q9Y473 711 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GJB3O75712 270 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CPOXP36551 454 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAGEA8P43361 318 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR1D4P47884 311 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FASLGP48023 281 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PITPNBP48739 271 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GLO1Q04760 184 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TAZQ16635 292 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ARSKQ6UWY0 536 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SPTSSAQ969W0 71 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CUTCQ9NTM9 273 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 STUB1Q9UNE7 303 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.71□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MMP2P08253 660 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 NPIPA8P0DM63 369 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CPMP14384 443 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RAB3BP20337 219 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CTHP32929 405 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GABARAPL2P60520 117 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 PROX2Q3B8N5 592 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CDNFQ49AH0 187 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GPR149Q86SP6 731 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CDS1Q92903 461 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms