RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ZZEF1O43149 2961 aa7.84□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH4A6NGS2 130 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 GSTA4O15217 222 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HS6ST1O60243 411 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN2O60636 221 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 FCMRO60667 390 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJA2O60884 412 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 UGT2B11O75310 529 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 STX11O75558 287 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PDE5AO76074 875 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 UTS2O95399 124 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPA8P0DM63 369 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CYP4B1P13584 511 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 NAGAP17050 411 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 AQP1P29972 269 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CYB561P49447 251 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HLCSP50747 726 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PNLIPRP2P54317 469 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ARG2P78540 354 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CHRNEQ04844 493 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 RBBP4Q09028 425 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TUBA3CQ13748 450 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 EFR3AQ14156 821 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 GPR68Q15743 365 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MAPK11Q15759 364 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 NTRK2Q16620 822 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ST3GAL2Q16842 350 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 VMACQ2NL98 169 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DESI1Q6ICB0 168 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 REEP3Q6NUK4 255 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ZAR1Q86SH2 424 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MICU2Q8IYU8 434 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HIPK4Q8NE63 616 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TMCO6Q96DC7 493 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PRORYQ9H606 182 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 RUBCNLQ9H714 662 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CALML5Q9NZT1 146 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MKLN1Q9UL63 735 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 WDR45Q9Y484 360 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MGAQ8IWI9 3026 aa7.83□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ITPR1Q14643 2758 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JPF8 293 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H15A6NDH6 313 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 TP53I11O14683 189 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 GSC2O15499 205 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA0513O60268 411 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 ICOSLGO75144 302 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PGM3O95394 542 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 FAM87AP0C7U9 286 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PCGF2P35227 344 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 PGM1P36871 562 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 DCTP40126 519 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CD96P40200 585 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 KCNAB2Q13303 367 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM7Q14002 265 aa7.82□□□□□ -1.16
SGMS1-211ENST00000626236 OR1C1Q15619 314 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms