RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TREM1	Q9NP99	234 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF21	Q9NSA1	209 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NSG2	Q9Y328	171 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JNG1	304 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	hDV102S1	A0JD36	115 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SMCO3	A2RU48	225 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM178B	H3BS89	294 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NR5A2	O00482	541 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7A17	O14581	309 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RS1	O15537	224 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RX6	O15547	441 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKAB2	O43741	272 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CLPX	O76031	633 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TOX	O94900	526 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK14	O94921	469 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN9	O95484	217 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP2A	P05549	437 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FCER2	P06734	321 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	H2BFM	P0C1H6	154 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKAR1A	P10644	381 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	UMPS	P11172	480 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF5	P12034	268 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	AOC1	P19801	751 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PGC	P20142	388 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTM3	P21266	225 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PCMT1	P22061	227 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GPX3	P22352	226 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GJB2	P29033	226 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC1A4	P43007	532 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GYG1	P46976	350 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ3	P48549	501 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SGSH	P51688	502 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNB2	P52799	333 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PLTP	P55058	493 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OSTN	P61366	133 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TPM4	P67936	248 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	XIAP	P98170	497 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OGDH	Q02218	1023 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZP4	Q12836	540 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF10	Q12962	218 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLA	Q13239	276 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTA1	Q13424	505 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DS5	Q14953	304 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FCN2	Q15485	313 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	VAMP3	Q15836	100 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR33	Q49SQ1	333 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	BEX5	Q5H9J7	111 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPN	Q5VXI9	398 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2A2	Q6IF42	318 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf74	Q6P047	294 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK6	Q6PKX4	331 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ASRGL1	Q7L266	308 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS6	Q7L5N1	327 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMOD1	Q8N336	334 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ALLC	Q8N6M5	410 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2L3	Q8NG85	312 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		2.46	□□□□□ -2.02

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