RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 ARFIP2P53365 341 aa8.54□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.54□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TNFSF11O14788 317 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 STK16O75716 305 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CD40P25942 277 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 IL2RGP31785 369 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 CASP2P42575 452 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 NUDT13Q86X67 352 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 VWA7Q9Y334 891 aa8.53□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA8RI6L899 631 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PGRMC2O15173 223 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TMPRSS11DO60235 418 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 STAMBPO95630 424 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TACSTD2P09758 323 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 MLNP12872 115 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 VPS41P49754 854 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PGGT1BP53609 377 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 MAP4K2Q12851 820 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-211ENST00000559460 OR52N5Q8NH56 324 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 FAM110BQ8TC76 370 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ABHD3Q8WU67 409 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM186Q96B77 213 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 ASB4Q9Y574 426 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0A6YYD5 115 aa8.51□□□□□ -1.05
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