RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554882.5

HECTD1-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 5

Gene HECTD1, Length 3,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-208	ENST00000554882	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	KRT33A	O76009	404 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	UTS2	O95399	124 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CBX7	O95931	251 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TUBB	P07437	444 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	POU2F1	P14859	743 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	UQCRB	P14927	111 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CD1E	P15812	388 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CCNA2	P20248	432 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	EVI2B	P34910	448 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	FOXA1	P55317	472 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	NME5	P56597	212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CLDN15	P56746	228 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	STX3	Q13277	289 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GPR68	Q15743	365 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CCT7	Q99832	543 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	MECR	Q9BV79	373 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882		A0A1B0GTL3	188 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GJE1	A6NN92	205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PLOD3	O60568	738 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	KIT	P10721	976 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	HOXC12	P31275	282 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	S100A3	P33764	101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ADH7	P40394	386 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	FOXO1	Q12778	655 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PON3	Q15166	354 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	STK11	Q15831	433 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69	3e-7	■■■■■ 31.3
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CLOCK	O15516	846 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	SCN2B	O60939	215 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	TOX	O94900	526 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	COPZ1	P61923	177 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	VSNL1	P62760	191 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ISL2	Q96A47	359 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.48	□□□□□ -1.69
HECTD1-208	ENST00000554882	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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