RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ANK1P16157 1881 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ESYT2A0FGR8 921 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MTX2O75431 263 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CALCAP01258 141 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CT45A8P0DMV1 189 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CT45A9P0DMV2 189 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RRASP10301 218 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PAX7P23759 505 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CCKBRP32239 447 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A8P48029 635 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 DNA2P51530 1060 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGA9Q13797 1035 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 KEAP1Q14145 624 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 BOLA3Q53S33 107 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 STKLD1Q8NE28 680 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF139Q8WU17 664 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NCLNQ969V3 563 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM45BQ96B21 275 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRG7Q96K78 797 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 S1PR3Q99500 378 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MEIS3Q99687 375 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPA33Q99795 319 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TCHPQ9BT92 498 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SATB2Q9UPW6 733 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.93□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 A8MVM7 634 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TULP2O00295 520 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PDXKO00764 312 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CHEK1O14757 476 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPK13O15264 365 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP6V0E1O15342 81 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CLDN1O95832 211 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 VTNP04004 478 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FCGR1AP12314 374 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP11B1P15538 503 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CA6P23280 308 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ACKR3P25106 362 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NOVP48745 357 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NR2C2P49116 596 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SNTA1Q13424 505 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC36A3Q495N2 470 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 XKR6Q5GH73 641 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM64Q6YI46 380 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR65Q8IYL9 337 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB119Q8N690 84 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NSL1Q96IY1 281 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 C4orf36Q96KX1 117 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FKRPQ9H9S5 495 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CALHM2Q9HA72 323 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 COX16Q9P0S2 106 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.92□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NUMA1Q14980 2115 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIP11Q15643 1979 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALS8O00214 317 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SAP30O75446 220 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4F21O95013 312 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MBD3O95983 291 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF883P0CG24 379 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF5P12034 268 aa4.91□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPX3P22352 226 aa4.91□□□□□ -1.62
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