RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM10	Q96HG1	83 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MYADM	Q96S97	322 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF649	Q9BS31	505 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PHF11	Q9UIL8	331 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQ09	198 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	POM121B	A6NF01	834 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CPN2	P22792	545 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HTR3A	P46098	478 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	BCL2A1	Q16548	175 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PARM1	Q6UWI2	310 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SYT14	Q8NB59	555 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GABRG3	Q99928	467 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RERGL	Q9H628	205 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SEC14L5	O43304	696 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PIP5K1C	O60331	668 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CH25H	O95992	272 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	LALBA	P00709	142 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SOX18	P35713	384 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ASB12	Q8WXK4	309 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FGF14	Q92915	247 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A5	Q96R48	311 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SERINC2	Q96SA4	455 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TEX12	Q9BXU0	123 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	WDR45	Q9Y484	360 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		15.8	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	IGHA1	P01876	353 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GAA	P10253	952 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NTSR1	P30989	418 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF136	P52737	540 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ACSM1	Q08AH1	577 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ASAH1	Q13510	395 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RUNX2	Q13950	521 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DSG2	Q14126	1118 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP5	Q16690	384 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DDI2	Q5TDH0	399 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF544	Q6NX49	715 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	COL26A1	Q96A83	441 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	P2RX6	O15547	441 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TNFSF14	O43557	240 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CCNK	O75909	580 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HTR1F	P30939	366 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN2	P57739	230 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SCN1B	Q07699	218 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP8	Q13202	625 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	USP53	Q70EK8	1073 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	AP3S1	Q92572	193 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	JAM3	Q9BX67	310 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	IGFLR1	Q9H665	355 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CBLC	Q9ULV8	474 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		15.79	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FABP12	A6NFH5	140 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058		A8MU76	341 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDC42EP2	O14613	210 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CTSV	O60911	334 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	THBS1	P07996	1170 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KIR2DS3	Q14952	304 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		15.78	■□□□□ 0.12

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