RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP12Q02952 1782 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CD34P28906 385 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PSPHP78330 225 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF616Q08AN1 781 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 OR7G3Q8NG95 312 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CPT1CQ8TCG5 803 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FIZ1Q96SL8 496 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR6Q9GZN1 396 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HHATLQ9HCP6 504 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NME4O00746 187 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NKX3-2P78367 333 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ERV3-1Q14264 604 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ABCG5Q9H222 651 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NOTOA8MTQ0 251 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ACTL6BO94805 426 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GDF1P27539 372 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HOXC5Q00444 222 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 JRKO75564 520 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 KNG1P01042 644 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 OSMP13725 252 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SERTAD2Q14140 314 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PAGE3Q5JUK9 113 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PVRP15151 417 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB3Q13509 450 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GSG1LQ6UXU4 331 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DPPA4Q7L190 304 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A9Q7RTY1 509 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HCSTQ9UBK5 93 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV18A0A075B6X5 111 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NCS1P62166 190 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ANKK1Q8NFD2 765 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP10Q96AY3 582 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CDC6Q99741 560 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 UBL4AP11441 157 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB5P28074 263 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 XCR1P46094 333 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HMX3A6NHT5 357 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ADAP00813 363 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LCTLQ6UWM7 567 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FUNDC2Q9BWH2 189 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PNCKQ6P2M8 343 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RANBP10Q6VN20 620 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM14Q96QK8 99 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ARL6Q9H0F7 186 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS38A1L453 326 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SCGB2A1O75556 95 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN3P20807 821 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC1AQ8NC01 280 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FGF13Q92913 245 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA3Q9HB20 300 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DDCP20711 480 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DNASE1P24855 282 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GCH1P30793 250 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 OR5M10Q6IEU7 315 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PREBQ9HCU5 417 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ABRACLQ9P1F3 81 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ENPP4Q9Y6X5 453 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TCHHQ07283 1943 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CDC14CA4D256 554 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TVP23AA6NH52 213 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CPOQ8IVL8 374 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GPR39O43194 453 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFB2O95178 105 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms