RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 APH1BQ8WW43 257 aa13.58□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 C11orf16Q9NQ32 467 aa13.58□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.58□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 A8MUA0 341 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 E9PQ18 207 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 BRINP1O60477 761 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PRAMEF2O60811 474 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 THBS1P07996 1170 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 GKN3PP0CG01 181 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MMP11P24347 488 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CNR2P34972 360 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MAP3K8P41279 467 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 AHSA2Q719I0 299 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 EID2Q8N6I1 236 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 RHOXF1Q8NHV9 184 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 NR4A3Q92570 626 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 FUZQ9BT04 418 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CLDN16Q9Y5I7 305 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 A0A087WUU8 490 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ENO4A6NNW6 628 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 KIAA0513O60268 411 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CPNE6O95741 557 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 NID1P14543 1247 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 SLC35A2P78381 396 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PERM1Q5SV97 790 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 XAF1Q6GPH4 301 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 TMEM71Q6P5X7 295 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 KMT5CQ86Y97 462 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MVB12AQ96EY5 273 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 OR10A5Q9H207 317 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 FTSJ1Q9UET6 329 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 KCNE5Q9UJ90 142 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 OR10H1Q9Y4A9 318 aa13.57□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZAR1LA6NP61 321 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 C17orf105B2RV13 164 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PATE3B3GLJ2 98 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 H3BMH7 237 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 RGS10O43665 173 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 SOX30O94993 753 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 IFNGR2P38484 337 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 NUDT6P53370 316 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CSNK2BP67870 215 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ILKQ13418 452 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZAR1Q86SH2 424 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CCDC103Q8IW40 242 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MORN4Q8NDC4 146 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 DIO2Q92813 273 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 LHPPQ9H008 270 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 DUSP21Q9H596 190 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 Q9N2J8 555 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ISOC1Q96CN7 298 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 VSTM2LQ96N03 204 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 TECTAO75443 2155 aa13.56□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 MAN1A2O60476 641 aa13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 NTN1O95631 604 aa13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 PTNP21246 168 aa13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 CCL7P80098 99 aa13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 COX10Q12887 443 aa13.55□□□□□ -0.24
NICN1-201ENST00000273598 VWA2Q5GFL6 755 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms