RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 DNASE2BQ8WZ79 361 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 IL4I1Q96RQ9 567 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GPA33Q99795 319 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CTPS2Q9NRF8 586 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FITM1A5D6W6 292 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 I3L1I5 382 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 M0R3G1 203 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN4O14493 209 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GPR68Q15743 365 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GDF7Q7Z4P5 450 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 BORCS5Q969J3 196 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PDE7BQ9NP56 450 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CTSBP07858 339 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 LIPAP38571 399 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SERPINB10P48595 397 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF136P52737 540 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NR1D2Q14995 579 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 DGUOKQ16854 277 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SIX5Q8N196 739 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TCEANCQ8N8B7 351 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PALMDQ9NP74 551 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.28■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TTC36A6NLP5 189 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 H0YIG0 161 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 HRO43593 1189 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 S1PR1P21453 382 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NR4A1P22736 598 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CCNJQ5T5M9 372 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 OR52R1Q8NGF1 315 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PIK3R3Q92569 461 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FGF11Q92914 225 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 LGALS12Q96DT0 336 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 VMP1Q96GC9 406 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.27■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 CDHR4A6H8M9 788 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF749O43361 778 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 KLF4O43474 513 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 PIAS2O75928 621 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 PTHP01270 115 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 GALNSP34059 522 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 GABRA3P34903 492 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 UGT2B10P36537 528 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TUBA1BP68363 451 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 RHAGQ02094 409 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 STX4Q12846 297 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 SLC13A2Q13183 592 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TUBA1AQ71U36 451 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 KIF18BQ86Y91 864 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 OSTF1Q92882 214 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM80Q96HE8 168 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 PRR14Q9BWN1 585 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 IRGMA1A4Y4 181 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 SNTNA6NMZ2 147 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 MED26O95402 600 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 HSD17B7P56937 341 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 MAPK14Q16539 360 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 SHISA5Q8N114 240 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 RIT1Q92963 219 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 SLC35B4Q969S0 331 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TEX12Q9BXU0 123 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 THY1P04216 161 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 C21orf59P57076 290 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF91Q05481 1191 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 MED25Q71SY5 747 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 PEX11GQ96HA9 241 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms