RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216658.9

PAPLN-201, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 4,182 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-201ENST00000216658 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 KRT74Q7RTS7 529 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 COQ8BQ96D53 544 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SAMD8Q96LT4 415 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 AKAP6Q13023 2319 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ARHGEF9O43307 516 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TSC22D2O75157 780 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RFKQ969G6 155 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PRR35P0CG20 571 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ZNF823P16415 610 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 LTBRP36941 435 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SOX2P48431 317 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CRISP1P54107 249 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 HSD11B2P80365 405 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 FZD2Q14332 565 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SERPINA11Q86U17 422 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 FANK1Q8TC84 345 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 HTRA1Q92743 480 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TSLPQ969D9 159 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TAMM41Q96BW9 452 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CCDC115Q96NT0 180 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 NANSQ9NR45 359 aa11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 A0A1W2PS29 197 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RETP07949 1114 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PLBD1Q6P4A8 553 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TCTN2Q96GX1 697 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SLITRK2Q9H156 845 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 IFT52Q9Y366 437 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 A0A0C4DFX4 3053 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ASPDHA6ND91 283 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RCBTB2O95199 551 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PAPLNO95428 1278 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CPNE6O95741 557 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 BMP2P12643 396 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TRIM23P36406 574 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 LIM2P55344 173 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TNFRSF17Q02223 184 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 TCEAL3Q969E4 200 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 DAPP1Q9UN19 280 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SH3D21A4FU49 640 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SIGLEC6O43699 453 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 RAD1O60671 282 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PRAMEF2O60811 474 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 FUCA1P04066 466 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 CD1CP29017 333 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SLC6A9P48067 706 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PDX1P52945 283 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 PYDC2Q56P42 97 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 LDAHQ9H6V9 325 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 FAM60AQ9NP50 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 C8orf4Q9NR00 106 aa11.59□□□□□ -0.55
PAPLN-201ENST00000216658 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PAPLN-201ENST00000216658 PCGF2P35227 344 aa11.58□□□□□ -0.56
PAPLN-201ENST00000216658 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PAPLN-201ENST00000216658 PON3Q15166 354 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms