RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	MPTX1	A8MV57	137 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AIP	O00170	330 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MRAS	O14807	208 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FFAR3	O14843	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ARPC3	O15145	178 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR42	O15529	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3BGRL	O75368	114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TULP3	O75386	442 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINA1	P01009	418 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	IQCF3	P0C7M6	154 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AKT2	P31751	481 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MAS1L	P35410	378 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RFX2	P48378	723 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB11A	P62491	216 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF616	Q08AN1	781 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TUBB3	Q13509	450 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB11B	Q15907	218 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC38A4	Q969I6	547 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LRCH3	Q96II8	777 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A1W2PP18	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		A6NIZ1	184 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C4orf47	A7E2U8	309 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BML4	177 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	HAS3	O00219	553 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC1A7	O00341	560 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GLRA3	O75311	464 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AP2A2	O94973	939 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CNIH1	O95406	144 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ITGAM	P11215	1152 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DCTD	P32321	178 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TNFSF8	P32971	234 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LIPA	P38571	399 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	VIPR2	P41587	438 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GCGR	P47871	477 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EPHB3	P54753	998 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TAS2R39	P59534	338 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SEMG2	Q02383	582 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	HNF4G	Q14541	408 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EXT1	Q16394	746 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LEMD1	Q68G75	181 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	COQ8B	Q96D53	544 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PERP	Q96FX8	193 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM210B	Q96KR6	192 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CPNE1	Q99829	537 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AGPAT1	Q99943	283 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF6	Q9Y252	685 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LNP1	A1A4G5	178 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CXCR6	O00574	342 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	HCN1	O60741	890 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	IFNG	P01579	166 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	F11	P03951	625 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINA2	P20848	420 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AGXT	P21549	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	STOM	P27105	288 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AOAH	P28039	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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