RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF354BQ96LW1 612 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TCFL5Q9UL49 500 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF232Q9UNY5 417 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GXYLT2A0PJZ3 443 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT5O00445 386 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CLOCKO15516 846 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0513O60268 411 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FCMRO60667 390 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FESP07332 822 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 THBS1P07996 1170 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA2P17301 1181 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1C1P21283 382 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHBP21912 280 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf40Q8IXQ3 194 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SMYD1Q8NB12 490 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 APCDD1LQ8NCL9 501 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CATSPER1Q8NEC5 780 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 THSD1Q9NS62 852 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB9Q9UBS3 223 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 EXPH5Q8NEV8 1989 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOX3O15254 700 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPNS1P04632 268 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAR1BP31321 381 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 VHLP40337 213 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 STAT5AP42229 794 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A5P58743 744 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIP10Q15642 601 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HMBOX1Q6NT76 420 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53INP1Q96A56 240 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPBAP1Q96EW2 488 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS50Q96JG6 964 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf34Q96L11 122 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 WWTR1Q9GZV5 400 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF700Q9H0M5 742 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MKLN1Q9UL63 735 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM149AA5PLN7 773 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TO15178 435 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD1O60671 282 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DPM1O60762 260 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CST1P01037 141 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN1P31025 176 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SSPNQ14714 243 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DECR1Q16698 335 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNJQ5T5M9 372 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HSDL2Q6YN16 418 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 NUBPLQ8TB37 319 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP250Q9BV73 2442 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP5A6NIR3 686 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CDRT15L2A8MXV6 281 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS23O95084 383 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DBIP07108 87 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF311Q5JNZ3 666 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FIGNL1Q6PIW4 674 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR32P1Q8NGA4 272 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52P1PQ8NH57 321 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF347Q96SE7 839 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF4P78317 190 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 VLDLRP98155 873 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DNASE1L3Q13609 305 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PCOLCEQ15113 449 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR68Q15743 365 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 EXT1Q16394 746 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OLIG3Q7RTU3 272 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 AMIGO2Q86SJ2 522 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 BCORP1Q8N888 145 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF441Q8N8Z8 693 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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CAPNS1-206ENST00000588815 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 EVA1AQ9H8M9 152 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DLL3Q9NYJ7 618 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3GLB1Q9Y371 365 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX1O43933 1283 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 LGI1O95970 557 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-ND1P03886 318 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNW1P05000 195 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IL7RP16871 459 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM7Q19AV6 140 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 FLYWCH1Q4VC44 716 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 EIPR1Q53HC9 387 aa28.7■■■□□ 2.18
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