RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	CAPN1	P07384	714 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ANXA3	P12429	323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TPSB2	P20231	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SLC1A4	P43007	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SLC7A2	P52569	658 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	OSTN	P61366	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PCK2	Q16822	640 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	VCX2	Q9H322	139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	UBXN8	O00124	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PDHX	O00330	501 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	BTN3A3	O00478	584 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CASK	O14936	926 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	DCX	O43602	365 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	NUDT14	O95848	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	JCHAIN	P01591	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	IGHG3	P01860	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	WNT2	P09544	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	IGFBP5	P24593	272 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	BRCC3	P46736	316 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PLA2G16	P53816	162 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PDK3	Q15120	406 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RAB35	Q15286	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SYPL1	Q16563	259 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CYS1	Q717R9	158 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	FAM3C	Q92520	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SP140L	Q9H930	580 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ARPC3	O15145	178 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	EFNA2	O43921	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	BCKDHA	P12694	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TBXA2R	P21731	343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	LMO2	P25791	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	GSK3B	P49841	420 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	EMD	P50402	254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	CSRP3	P50461	194 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ATP4B	P51164	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	MFAP2	P55001	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	MAPK6	Q16659	721 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SENP1-208	ENST00000551592	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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