RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	STC1	P52823	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KCNK10	P57789	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ERVK-8	P63133	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CCL7	P80098	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	IFITM3	Q01628	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ID2	Q02363	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CD300C	Q08708	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CD47	Q08722	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	C1orf61	Q13536	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MLC1	Q15049	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ACOX1	Q15067	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	EXT2	Q93063	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ALG14	Q96F25	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CGREF1	Q99674	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MYLK	Q15746	1914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		A0A087WWL8	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		A0A1W2PQM1	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		D6RAR5	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		M0QX08	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		M0R3H8	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CDC7	O00311	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RAD51B	O15315	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SNX2	O60749	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	UGT2B11	O75310	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	INMT	O95050	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MLYCD	O95822	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FGF1	P05230	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CTSL	P07711	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PSG1	P11464	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	IL1RN	P18510	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RYK	P34925	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HPCAL1	P37235	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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