RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 OR52B2Q96RD2 323 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 DRC3Q9H069 523 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 GBA3Q9H227 469 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 RHOJQ9H4E5 214 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 COG4Q9H9E3 785 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CHST11Q9NPF2 352 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 NME7Q9Y5B8 376 aa3.86□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 A0A0J9YVX5 310 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 E9PBE3 544 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 AP3B1O00203 1094 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SDHDO14521 159 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 RTL8CO15255 209 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 KLHL41O60662 606 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 GRAP2O75791 330 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CNMDO75829 334 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PGM3O95394 542 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 C2P06681 752 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 IQCF3P0C7M6 154 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 GOT1P17174 413 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PSMC3P17980 439 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CYP2B6P20813 491 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ME2P23368 584 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PTPN3P26045 913 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MATKP42679 507 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 DNAJB13P59910 316 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF33AQ06730 810 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CEACAM7Q14002 265 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 KRT33BQ14525 404 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MAPRE2Q15555 327 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB6Q15916 424 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ANKFN1Q8N957 763 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 URGCPQ8TCY9 931 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 RCN3Q96D15 328 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 HDAC11Q96DB2 347 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ASB9Q96DX5 294 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 VPS39Q96JC1 886 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 CMTM3Q96MX0 182 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 TSGA13Q96PP4 275 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 GCNAQ96QF7 691 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 NPY6RQ99463 290 aa3.85□□□□□ -1.79
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SGCE-211ENST00000522045 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 MUC13Q9H3R2 512 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 WDR41Q9HAD4 459 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 C8orf4Q9NR00 106 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 DPP3Q9NY33 737 aa3.85□□□□□ -1.79
SGCE-211ENST00000522045 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
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