RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CRLF2Q9HC73 371 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MED17Q9NVC6 651 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ETNK2Q9NVF9 386 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 NLGN3Q9NZ94 848 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 KLRF1Q9NZS2 232 aa1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF175Q9Y473 711 aa1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 BTN3A3O00478 584 aa1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 PHYHD1Q5SRE7 291 aa1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 BRWD1-AS2P59051 145 aa1.98□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa1.98□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 LINC01620Q4KN68 170 aa1.98□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ANXA8L1Q5VT79 327 aa1.98□□□□□ -2.09
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