RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIK3R3	Q92569	461 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX37	Q96LM6	180 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF597	Q96LX8	424 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GNRHR2	Q96P88	292 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	AIG1	Q9NVV5	245 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBLC	Q9ULV8	474 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCL21	O00585	134 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX4	O95219	450 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL12B	P29460	328 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTGS2	P35354	604 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NME5	P56597	212 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	UFM1	P61960	85 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIL	Q7L0X0	811 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PACS2	Q86VP3	889 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52B2	Q96RD2	323 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPG11	Q96JI7	2443 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1B0GVC2	190 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C17orf51	A8MQB3	221 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAM10	O14672	748 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CFLAR	O15519	480 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCN2B	O60939	215 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCB7	O75027	752 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NKX2-2	O95096	273 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGKV1D-16	P01601	117 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPO	P07202	933 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GDF1	P27539	372 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL12A	P29459	219 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT20	P35900	424 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MASP1	P48740	699 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HBA1	P69905	142 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFR3A	Q14156	821 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DUSP5	Q16690	384 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NXN	Q6DKJ4	435 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAOX	Q6QHF9	649 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NATD1	Q8N6N6	113 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR151	Q8TDV0	419 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF138	Q8WVD3	245 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC9A6	Q92581	669 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMCO6	Q96DC7	493 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARK4	Q96L34	752 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C7orf26	Q96N11	449 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOCK7	Q96N67	2140 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBQLN3	Q9H347	655 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RUBCNL	Q9H714	662 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q9N2J8	555 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325		B4DXG7	233 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325		C9JVG2	144 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRRG2	O14669	202 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNPH	O15079	494 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL33	O95760	270 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1

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