RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 OPN1LWP04000 364 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 UROSP10746 265 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 IGFBP2P18065 325 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DNASE1P24855 282 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EVI2BP34910 448 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TIMP3P35625 211 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SOX18P35713 384 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PTGDSP41222 190 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ5P48544 419 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 IST1P53990 364 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PNLIPRP2P54317 469 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SNTA1Q13424 505 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GAB1Q13480 694 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SGCBQ16585 318 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 LIPMQ5VYY2 423 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GATSQ8NAP1 163 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MZB1Q8WU39 189 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PIK3R3Q92569 461 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPCDCQ96CD2 204 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EGLN2Q96KS0 407 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 VSTM2LQ96N03 204 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 BTBD9Q96Q07 612 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CALHM2Q9HA72 323 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MYNNQ9NPC7 610 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OXSMQ9NWU1 459 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf109Q9NX04 203 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FETUBQ9UGM5 382 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MID2Q9UJV3 735 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CD8B2A6NJW9 211 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A20A6NK97 555 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 A6NNC1 897 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM233B4DJY2 109 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 UPK1AO00322 258 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PLOD2O00469 737 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TO15178 435 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CFLARO15519 480 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFB5O43674 189 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PLOD3O60568 738 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TSPAN2O60636 221 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM13O60858 407 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CTAG2O75638 210 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KCNH1O95259 989 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PRPS2P11908 318 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 HPGDP15428 266 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SRD5A2P31213 254 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GSTM5P46439 218 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R2AP63151 447 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CDC20BQ86Y33 519 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MEIOBQ8N635 442 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAM222BQ8WU58 562 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ERP27Q96DN0 273 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ELP4Q96EB1 424 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35A4Q96G79 324 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 POM121Q96HA1 1249 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf50Q9BV19 199 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MECRQ9BV79 373 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PINK1Q9BXM7 581 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CENPHQ9H3R5 247 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
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