RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSG101Q99816 390 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL16Q9H2A7 254 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTCH1Q9NZJ7 389 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEC1Q9P2X7 70 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC14L4Q9UDX3 406 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SWAP70Q9UH65 585 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC4Q9Y296 219 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SONP18583 2426 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RYR2Q92736 4967 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PNM2 257 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PRG0 241 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE10A6NGK3 116 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BRN7 92 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLR4O00206 839 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF14O43557 240 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCRTR1O43613 425 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A12O75746 678 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNT2P09544 360 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2T7P0C7T2 308 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD59P13987 128 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX7A2P14406 83 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX7A1P24310 79 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCR7P32248 378 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPA7P48741 367 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 F2RL1P55085 397 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN15P56746 228 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASIC1P78348 528 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXC5Q00444 222 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF763Q0D2J5 394 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RALGDSQ12967 914 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 BIKQ13323 160 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIPK1Q13546 671 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPARCL1Q14515 664 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9A3R2Q15599 337 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 AANATQ16613 207 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD16Q68DU8 428 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCEAL6Q6IPX3 200 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf99Q6UWK7 81 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFN1Q8IWA4 741 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf18Q8NEA5 215 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8H1Q8NGG4 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10G9Q8NGN4 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR9A2Q8NGT5 310 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDCBP2Q9H190 292 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP21Q9H596 190 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RABEP2Q9H5N1 569 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXC10Q9NYD6 342 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF492Q9P255 531 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCDC2Q9UHG0 476 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB3Q9Y575 518 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCA12Q86UK0 2595 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYSFO75923 2080 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GVC2 190 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ESYT2A0FGR8 921 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCRTR2O43614 444 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUPT3HO75486 399 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF13O75888 250 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8U8P0C7N1 319 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1-13P0DP09 117 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTN1P12814 892 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATF6P18850 670 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP11B2P19099 503 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NF2P35240 595 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASMTP46597 345 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTENP60484 403 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOLH1Q04609 750 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR50Q13585 617 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CUL4BQ13620 913 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
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