RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL20Q96IG2 436 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 STACQ99469 402 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PIP5K1AQ99755 562 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PINK1Q9BXM7 581 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PIGUQ9H490 435 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TOR3AQ9H497 397 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 REEP1Q9H902 201 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 STARD5Q9NSY2 213 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 EXD2Q9NVH0 621 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SATB2Q9UPW6 733 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.61□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM221A6NGB7 291 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 M0R296 226 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TNFRSF11BO00300 401 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF749O43361 778 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGA12O60330 932 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 LDB3O75112 727 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 UGT2B11O75310 529 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 NKX2-2O95096 273 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 BMP10O95393 424 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CBX7O95931 251 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ONECUT2O95948 504 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 AK1P00568 194 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 IFNW1P05000 195 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CT62P0C5K7 136 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ANXA8P13928 327 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TNFRSF1BP20333 461 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CBLP22681 906 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 IGFBP5P24593 272 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH4A1P30038 563 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PRKAR1BP31321 381 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PTGER1P34995 402 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 OR1E2P47887 323 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 AVPR1BP47901 424 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH3B2P48448 385 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PRKAG1P54619 331 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HSD17B7P56937 341 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 FUT7Q11130 342 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP8Q13202 625 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 IKZF1Q13422 519 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 NR0B2Q15466 257 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP5Q16690 384 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MICAQ29983 383 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-BQ31612 363 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 C4orf46Q504U0 113 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF691Q5VV52 312 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 KRT80Q6KB66 452 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 COMTD1Q86VU5 262 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PARP8Q8N3A8 854 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SMYD1Q8NB12 490 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CEP76Q8TAP6 659 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GIPC3Q8TF64 312 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CYGBQ8WWM9 190 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PROX1Q92786 737 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF566Q969W8 418 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MAGED4Q96JG8 741 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MUS81Q96NY9 551 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 COL21A1Q96P44 957 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 OR1F2PQ96R84 312 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SDF2Q99470 211 aa5.6□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGDIGQ99819 225 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms