RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 GPR68Q15743 365 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 TBCELQ5QJ74 424 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 HSDL2Q6YN16 418 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 BCORP1Q8N888 145 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 ZNF441Q8N8Z8 693 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 GPR32P1Q8NGA4 272 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 CBLCQ9ULV8 474 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 TMEM200CA6NKL6 621 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 SUV39H1O43463 412 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 TIPRLO75663 272 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 BAG2O95816 211 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 UMPSP11172 480 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 ETS2P15036 469 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 ANPEPP15144 967 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 SDHBP21912 280 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 DRD5P21918 477 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 AP2B1P63010 937 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 BTBD16Q32M84 506 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 ZFP1Q6P2D0 407 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 SLC29A4Q7RTT9 530 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 PRR22Q8IZ63 422 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 VMP1Q96GC9 406 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.52■■□□□ 1.04
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR6C76A6NM76 312 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 STX11O75558 287 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CD247P20963 164 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 KCNJ10P78508 379 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 MAPK14Q16539 360 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 VRK2Q86Y07 508 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZNF607Q96SK3 696 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DOHHQ9BU89 302 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CHID1Q9BWS9 393 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZNF160Q9HCG1 818 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 THSD1Q9NS62 852 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ARMC1Q9NVT9 282 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.51■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PQ72 361 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FRG2CA6NGY1 282 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PEX12O00623 359 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 IGHEP01854 428 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 HPCAP84074 193 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DESI1Q6ICB0 168 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAF7Q7L592 441 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ELP5Q8TE02 316 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TMBIM1Q969X1 311 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 WDR70Q9NW82 654 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CALML5Q9NZT1 146 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SEC14L3Q9UDX4 400 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CLDN24A6NM45 220 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 EPPINO95925 133 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SEMG1P04279 462 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR1E2P47887 323 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 KRT73Q86Y46 540 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PKP2Q99959 881 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.5■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FRYQ5TBA9 3013 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PDE9AO76083 593 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SOX30O94993 753 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CHRNB3Q05901 458 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 VASH2Q86V25 355 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 KCND3Q9UK17 655 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FBXL4Q9UKA2 621 aa21.49■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TTC36A6NLP5 189 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PCDH17O14917 1159 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 KIAA0513O60268 411 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SERPINB7O75635 380 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 AK1P00568 194 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 IFNA14P01570 189 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RAP2AP10114 183 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 KCNJ5P48544 419 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SESN3P58005 492 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 Q0VFX4 171 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms