RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 ACSM2BQ68CK6 577 aa23.14■■□□□ 1.3
PKDCC-201ENST00000294964 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PKDCC-201ENST00000294964 FAM26EQ8N5C1 309 aa23.14■■□□□ 1.3
PKDCC-201ENST00000294964 LIPT1Q9Y234 373 aa23.14■■□□□ 1.3
PKDCC-201ENST00000294964 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 HIDE1A8MVS5 230 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 RGS11O94810 467 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MPC1LP0DKB6 136 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 PPM1AP35813 382 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZP1P60852 638 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 OPCMLQ14982 345 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 HSD17B12Q53GQ0 312 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 LURAP1LQ8IV03 231 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SAP130Q9H0E3 1048 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.14■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 A8MXK9 166 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SH3BP5O60239 455 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IDSP22304 550 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 LCN1P31025 176 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 C21orf58P58505 322 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 RAE1P78406 368 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 OR4K1Q8NGD4 311 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SLAMF7Q9NQ25 335 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IL20Q9NYY1 176 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 POMT2Q9UKY4 750 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 LINC01387J3KSC0 135 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 TIMP2P16035 220 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 HBA1P69905 142 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SHFQ7M4L6 423 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SFXN2Q96NB2 322 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SLC38A2Q96QD8 506 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 NPAS1Q99742 590 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ISYNA1Q9NPH2 558 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 C1GALT1Q9NS00 363 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SEMA3GQ9NS98 782 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.13■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 FAM170BA6NMN3 283 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 GABRPO00591 440 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 OR12D1P0DN82 309 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ETFDHQ16134 617 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 GSG1Q2KHT4 349 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IL20RBQ6UXL0 311 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 GPR135Q8IZ08 494 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IRF7Q92985 503 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 NRTNQ99748 197 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZBP1Q9H171 429 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 TRANK1O15050 2925 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 USP34Q70CQ2 3546 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SSNA1O43805 119 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CTSAP10619 480 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 GIFP27352 417 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SELENOPP49908 381 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IDNKQ5T6J7 187 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 LYPD4Q6UWN0 246 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM159Q96B96 161 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA2Q9UM82 520 aa23.12■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CARNS1A5YM72 827 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CD8B2A6NJW9 211 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 DVL2O14641 736 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 IFNA14P01570 189 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CA3P07451 260 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CD8BP10966 210 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 VIPR1P32241 457 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 RPS13P62277 151 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 MC1RQ01726 317 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF385BQ569K4 471 aa23.11■■□□□ 1.29
PKDCC-201ENST00000294964 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms