RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYP17A1P05093 508 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACTBP60709 375 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACTG1P63261 375 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 STEAP3Q658P3 488 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MUL1Q969V5 352 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIF3AQ9Y2N7 669 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 IRS2Q9Y4H2 1338 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANTXRLA6NF34 631 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 EDIL3O43854 480 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 GYPBP06028 91 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CTXN1P60606 82 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf61Q13536 156 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAB11FIP2Q7L804 512 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 DEFB119Q8N690 84 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CREB3L4Q8TEY5 395 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 POM121CA8CG34 1229 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 VEGFDO43915 354 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CASP3P42574 277 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 AAK1Q2M2I8 961 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CBLL1Q75N03 491 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCDC2BA2VCK2 349 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF850A8MQ14 1090 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACOT8O14734 319 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 PM20D2Q8IYS1 436 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR5AK2Q8NH90 309 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 LMX1AQ8TE12 382 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA0355O15063 1070 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 AHRP35869 848 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MANEALQ5VSG8 457 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 UNC5DQ6UXZ4 953 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR5AR1Q8NGP9 310 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR1A2Q9Y585 309 aa12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TACR1P25103 407 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 GSTM4Q03013 218 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACSM3Q53FZ2 586 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 NADSYN1Q6IA69 706 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM25Q86YD3 366 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNTN4Q8IWV2 1026 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2T4Q8NH00 348 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM45AQ9NWC5 275 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAS2R16Q9NYV7 291 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MT-ND4P03905 459 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RHOP08100 348 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 LIPCP11150 499 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSMB10P40306 273 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MC3RP41968 323 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM205BPQ63HN1 556 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAD51DO75771 328 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SHC2P98077 582 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR7G2Q8NG99 324 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 MACROD1Q9BQ69 325 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLDN24A6NM45 220 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 C2orf74A8MZ97 194 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 F5H5P2 479 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR8U9P0C7N5 309 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF91Q05481 1191 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF529Q6P280 563 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RASGRP3Q8IV61 690 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM46BQ96A09 425 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF583Q96ND8 569 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLMPQ9H6B4 373 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 FZD3Q9NPG1 666 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 BPNT1O95861 308 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 POU3F4P49335 361 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPRED1Q7Z699 444 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 LAS2Q8IYD9 372 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLF15Q9UIH9 416 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 RGRP47804 291 aa12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC9B2Q86UD5 537 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms