RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f26J3QNK2 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f8J3QQ50 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f17L7MU81 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f18L7MU83 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r61L7N2B8 865 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hk2O08528 917 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P01803 113 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc2a7P0C6A1 513 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 F3P20352 294 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab12P35283 243 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Etv1P41164 477 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Matn1P51942 500 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 B3gntl1Q3U129 357 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Itgb2lQ3UV74 738 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prtn3Q61096 254 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Alg8Q6P8H8 526 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccdc126Q8BIS8 140 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Guf1Q8C3X4 651 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rwdd3Q8VIL2 267 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GMCL1P1Q99N64 498 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MINDY3Q9CV28 444 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gtpbp8Q9CY28 285 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gkn3Q9D0T7 191 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tomm20lQ9D4V6 152 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gmeb1Q9JL60 562 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mapk7Q9WVS8 806 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cacna1bO55017 2327 aa6.71□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r39G3UWE6 305 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Suv39h1O54864 412 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc22a8O88909 537 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd5P13379 494 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LynP25911 512 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pax4P32115 349 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tsr3Q5HZH2 323 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snrnp70Q62376 448 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Angptl1Q640P2 490 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RgmaQ6PCX7 454 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 IfneQ80ZF2 192 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Neurl3Q8CJC5 254 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp940Q8R2Q3 566 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr768Q8VGC4 312 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Acy3Q91XE4 318 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf144aQ925F3 292 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem41aQ9D8U2 264 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LipaQ9Z0M5 397 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trbc2A0A075B5J4 173 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm28710A0A1B0GR31 962 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Xlr5aA2BI45 236 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P01851 173 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hoxa10P31310 416 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sftpa1P35242 248 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GifP52787 417 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 UbqlnlQ14DL0 610 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem248Q3TBN1 314 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ankrd37Q569N2 159 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gstt2Q61133 244 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf122Q8BP31 155 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Piwil4Q8CGT6 848 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sla2Q8R4L0 259 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdhr5Q8VHF2 831 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cpt1bQ924X2 772 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lyrm1Q9CQB7 122 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prokr1Q9JKL1 393 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cxcl15Q9WVL7 167 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plxna4Q80UG2 1893 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spta1P08032 2415 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm266A6H634 200 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 F10O88947 481 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ca2P00920 260 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ttf1Q62187 859 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 DdnQ80TS7 710 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zadh2Q8BGC4 377 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lyve1Q8BHC0 318 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eps8l3Q91WL0 600 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc5a2Q923I7 670 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TympQ99N42 471 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cngb3Q9JJZ9 694 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spry4Q9WTP2 300 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ptpn4Q9WU22 926 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm29554A0A087WNW4 188 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SrcP05480 541 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kif18bQ6PFD6 834 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CrhQ8CIT0 187 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Psg16Q8K0U8 395 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trappc4Q9ES56 219 aa6.7□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trav5-1A0A075B5Z7 114 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm21885A0A286YDN8 145 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sult2a6B2RVI8 285 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ctnnd2O35927 1247 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Oprl1P35377 367 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Krt86P97861 486 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms