RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582486.5

GGA3-213, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene GGA3, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-213	ENST00000582486	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	TPST2	O60704	377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GAST	P01350	101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	RYK	P34925	604 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GCGR	P47871	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CCL7	P80098	99 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	IL5RA	Q01344	420 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	IL18R1	Q13478	541 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	KEAP1	Q14145	624 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SEC23B	Q15437	767 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GPR68	Q15743	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	NPTX1	Q15818	432 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	MVB12A	Q96EY5	273 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SYT5	O00445	386 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	YKT6	O15498	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	COQ9	O75208	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CPNE6	O95741	557 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	IFNA16	P05015	189 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	MSL3P1	P0C860	447 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	AGXT	P21549	392 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	STT3A	P46977	705 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	EMD	P50402	254 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PGD	P52209	483 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	NR1H2	P55055	460 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	DCST1	Q5T197	706 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CEP76	Q8TAP6	659 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486		A0A087WXM4	84 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	STX11	O75558	287 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	UGT2B17	O75795	530 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	OR6B1	O95007	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	NKX2-2	O95096	273 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CBL	P22681	906 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	HOXD12	P35452	270 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	TUBA4A	P68366	448 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	HOXC5	Q00444	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PSG6	Q00889	435 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SQSTM1	Q13501	440 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	MAPK14	Q16539	360 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-213	ENST00000582486	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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