RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	NPBWR2	P48146	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GNG10	P50151	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACLY	P53396	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	EFNB3	Q15768	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	P3H4	Q92791	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GBA3	Q9H227	469 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PPE3	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAB29	O14966	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	IFNA14	P01570	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPN2	P04844	631 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	IFNA6	P05013	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSKH1	P11801	424 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF23	P17027	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCR8	P51685	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP1B3	P54709	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLDN18	P56856	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SP3	Q02447	781 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	HNF4G	Q14541	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLCH2	O75038	1416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PQ67	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	AIM2	O14862	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	B4GAT1	O43505	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NOL4	O94818	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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