RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 MATN1P21941 496 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 RPP38P78345 283 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A25Q6KCM7 469 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 GALNT10Q86SR1 603 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC16A11Q8NCK7 471 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 COL21A1Q96P44 957 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1B-204ENST00000503638 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPN13Q12923 2485 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.33□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 CDK2AP1O14519 115 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 TO15178 435 aa12.32□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 MASP1P48740 699 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PLGLB1Q02325 96 aa12.32□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 EFR3AQ14156 821 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PAGE3Q5JUK9 113 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A10Q63ZE4 541 aa12.32□□□□□ -0.44
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