RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MPTX1A8MV57 137 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 D6RAR5 112 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QZQ0 153 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DPA1P20036 260 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2ADP20671 130 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP12P39900 470 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTM5P46439 218 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPKAPK2P49137 400 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ACVR1Q04771 509 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GSG1Q2KHT4 349 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MARC1Q5VT66 337 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT13Q86X67 352 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK17Q96T54 332 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFL8Q99944 293 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED9Q9BVK6 235 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD4Q9ULV1 537 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BN98 237 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MANBAO00462 879 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGESO14684 152 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GNB5O14775 395 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PAGE1O75459 146 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFP01133 1207 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 AHCYP23526 432 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPKAP23677 461 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.143e-7■■■□□ 15.6
RABGEF1-203ENST00000439720 ACADLP28330 430 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ3P48549 501 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MC2RQ01718 297 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GPNMBQ14956 572 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 IDNKQ5T6J7 187 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR135Q8IZ08 494 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 LPPQ93052 612 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SPON2Q9BUD6 331 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 EBPLQ9BY08 206 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD3Q9NPG1 666 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GSAPA4D1B5 854 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FFAR2O15552 330 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RECQL4O94761 1208 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX11BO96011 259 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SOD1P00441 154 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TFP02787 698 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DRD2P14416 443 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SDC1P18827 310 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C4BPBP20851 252 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PREPP48147 710 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENOWP63302 87 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MBTPS1Q14703 1052 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MANEALQ5VSG8 457 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms