RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CNIH4Q9P003 139 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 STT3AP46977 705 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A10P60903 97 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 HHIPQ96QV1 700 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS38A1L453 326 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CTBSQ01459 385 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CASTOR1Q8WTX7 329 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC120Q96HB5 630 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 LHPPQ9H008 270 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 HBQ1P09105 142 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SGSHP51688 502 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ACY1Q03154 408 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMA3BQ13214 749 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRRQ15256 657 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD9Q7L273 389 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TANKQ92844 425 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNN1Q92952 543 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 DPH1Q9BZG8 443 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SGK494L7N484 410 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 FRS3O43559 492 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NCDNQ9UBB6 729 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGB4P16144 1822 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ISPDA4D126 451 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKYO43930 277 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V1G1O75348 118 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN9O75954 239 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 HERV-K104P61576 105 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NFATC3Q12968 1075 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF175Q8N4F7 328 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2H4Q92759 462 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFB2O95178 105 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMB5P28074 263 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 RIN1Q13671 783 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NRG4Q8WWG1 115 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PGAM5Q96HS1 289 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2F2P13984 249 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP2K3P46734 347 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 FXYD6P3P58550 94 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 MGAT3Q09327 533 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KEAP1Q14145 624 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL26Q9Y258 94 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPB11Q9Y547 144 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP4K2Q12851 820 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 GALK2Q01415 458 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 DTX3Q8N9I9 347 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 STARD5Q9NSY2 213 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf105B2RV13 164 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R3DO95685 299 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDH17O14917 1159 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC20Q8TCA0 184 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SYPP08247 313 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CPOQ8IVL8 374 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PHYHO14832 338 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 LCKP06239 509 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 BMXP51813 675 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 GK3PQ14409 553 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ELP5Q8TE02 316 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 LDB3O75112 727 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGER1P34995 402 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms