RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XKRXQ6PP77 449 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRILQ7L0X0 811 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STON2Q8WXE9 905 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HGDQ93099 445 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3orf30Q96M34 536 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RILPQ96NA2 401 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STACQ99469 402 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBQLN3Q9H347 655 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBLCQ9ULV8 474 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOTCH2Q04721 2471 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUXAA6NLW8 204 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM166BA8MTA8 275 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCL21O00585 134 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPAN2O60636 221 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBR3O75828 277 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKX2-2O95096 273 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRATO95237 230 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL33O95760 270 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGR2O95994 175 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AK1P00568 194 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HPNP05981 417 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 G6PDP11413 515 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IDO1P14902 403 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDF1P27539 372 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIGAP37287 484 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K8P41279 467 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEA5P43359 124 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIR3DL1P43629 444 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSG6Q00889 435 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSTA3Q16772 222 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF385BQ569K4 471 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WLSQ5T9L3 541 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACAD11Q709F0 780 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MISPQ8IVT2 679 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP43Q8NFH3 380 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGARPQ8TDB4 240 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMBIM1Q969X1 311 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB18Q99592 522 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf50Q9BV19 199 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUSP26Q9BV47 211 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUF2Q9BZD4 464 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPY30Q9C005 99 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDAHQ9H6V9 325 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROK2Q9HC23 129 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEMO1Q9Y316 297 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FREM3P0C091 2139 aa7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0G2JMM0 328 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms