RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 VWA5B2Q8N398 1253 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ANKK1Q8NFD2 765 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GPR52Q9Y2T5 361 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 P2RY2P41231 377 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CTSCP53634 463 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PRPS1P60891 318 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TAS1R1Q7RTX1 841 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TANKQ92844 425 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 FGF13Q92913 245 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CHFRQ96EP1 664 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K3Q96R72 315 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RNF38Q9H0F5 515 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf42Q9NWW7 574 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GPR45Q9Y5Y3 372 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CITO14578 2027 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SYPP08247 313 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GNRHRP30968 328 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GJA8P48165 433 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 BMXP51813 675 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CDK3Q00526 305 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZSR6 202 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SYT4Q9H2B2 425 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CFL1P23528 166 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ART1P52961 327 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR9Q2Q8NGE9 314 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD8Q96LT4 415 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PINK1Q9BXM7 581 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 EMCNQ9ULC0 261 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB42B2RXF5 422 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 HRGP04196 525 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF35P13682 527 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT1P36639 197 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TM4SF4P48230 202 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NCS1P62166 190 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MALLQ13021 153 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 LAS2Q8IYD9 372 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A13Q96H72 371 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 EBF1Q9UH73 591 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MYH6P13533 1939 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YY10 115 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RGRP47804 291 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRG5Q8IZF4 528 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A7Q99884 636 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R8Q9NYW2 309 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SPEF1Q9Y4P9 236 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MEGF11A6BM72 1044 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MROH6A6NGR9 719 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PPP5CP53041 499 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PAQR9Q6ZVX9 377 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR9A2Q8NGT5 310 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 FAM46BQ96A09 425 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PARPBPQ9NWS1 579 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 H7C417 338 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NTRK2Q16620 822 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CDNFQ49AH0 187 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PNCKQ6P2M8 343 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ARSKQ6UWY0 536 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ASB11Q8WXH4 323 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A3Q99726 388 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG6Q9BXT2 260 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 H3BUI4 141 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GABBR2O75899 941 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 AOAHP28039 575 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 KEAP1Q14145 624 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 IQCF1Q8N6M8 205 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC29A1Q99808 456 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC32Q9BV29 185 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK13Q9HB14 408 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CD93Q9NPY3 652 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 POLE4Q9NR33 117 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 IL20RAQ9UHF4 553 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SEC14L5O43304 696 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ATE1O95260 518 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFB2P0C5Z0 115 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PNMTP11086 282 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF43P17038 809 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DNASE1P24855 282 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CDK5R2Q13319 367 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CPOQ8IVL8 374 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR13C3Q8NGS6 347 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms