RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 COX20Q5RI15 118 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MLXQ9UH92 298 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 GPX2P18283 190 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CEBPGP53567 150 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SPERTQ8NA61 448 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CTSAP10619 480 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ZNF20P17024 532 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TRAM1Q15629 374 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SETD6Q8TBK2 473 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 H0YIV9 168 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 C1orf61Q13536 156 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 IL21RQ9HBE5 538 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.54■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ADH1BP00325 375 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 GTF2F2P13984 249 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CPXM2Q8N436 756 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 THAP4Q8WY91 577 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CHFRQ96EP1 664 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CACNG3O60359 315 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS4O75173 837 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 AHRP35869 848 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MTFR2Q6P444 385 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 DTD2Q96FN9 168 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 HPGDSO60760 199 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ARL6Q9H0F7 186 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 OR10A4Q9H209 315 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 WASH3PC4AMC7 463 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 LAX1Q8IWV1 398 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 MNTQ99583 582 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 HCRTR2O43614 444 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 AHSA1O95433 338 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CSNK1DP48730 415 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 NKX3-2P78367 333 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SHC2P98077 582 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 E2F1Q01094 437 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CST6Q15828 149 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 KCTD9Q7L273 389 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 THAP6Q8TBB0 222 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 COQ3Q9NZJ6 369 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SPARCP09486 303 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 GKN3PP0CG01 181 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 PRLHRP49683 370 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SLC35A2P78381 396 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 LCTLQ6UWM7 567 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 SGTBQ96EQ0 304 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 PPT2Q9UMR5 302 aa20.52■□□□□ 0.88
USP12-201ENST00000282344 ARID1AO14497 2285 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms