RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR14I1A6ND48 311 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 UPK1AO00322 258 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SUSD5O60279 629 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TBX19O60806 448 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ABCB7O75027 752 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CELA3AP09093 270 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 BGNP21810 368 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 IL12BP29460 328 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HPCAL1P37235 193 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HSPB3Q12988 150 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 LIX1Q8N485 282 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 COL21A1Q96P44 957 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 C1orf50Q9BV19 199 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HCN1O60741 890 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 UGT2B11O75310 529 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PRPS2P11908 318 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 GDF1P27539 372 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 STX3Q13277 289 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 IL23RQ5VWK5 629 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR2L13Q8N349 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HGDQ93099 445 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SARAFQ96BY9 339 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ADOQ96SZ5 270 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ACAD8Q9UKU7 415 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 A0A1B0GVC2 190 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 AQP7O14520 342 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 BCKDKO14874 412 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC6AO75865 159 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SNTA1Q13424 505 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PDE7AQ13946 482 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EFR3AQ14156 821 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 XKRXQ6PP77 449 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 NODALQ96S42 347 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.49■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 IFI6P09912 130 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ADORA2A-AS1P86434 159 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PSG6Q00889 435 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TOMM20Q15388 145 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 GXYLT1Q4G148 440 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNF385BQ569K4 471 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 DESI1Q6ICB0 168 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TMEM211Q6ICI0 200 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SLC35A4Q96G79 324 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ICOSLGO75144 302 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 COL8A1P27658 744 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PTGR1Q14914 329 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SZRD1Q7Z422 152 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 GNRHR2Q96P88 292 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 Q9N2J8 555 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 GNB5O14775 395 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 AGAP20933 346 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PNLIPRP2P54317 469 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 BST1Q10588 318 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms