RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ACER3	Q9NUN7	267 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GLTP	Q9NZD2	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CD84	Q9UIB8	345 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GPR34	Q9UPC5	381 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NEU3	Q9UQ49	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	APC2	O95996	2303 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ANK1	P16157	1881 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PHYH	O14832	338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TSPAN6	O43657	245 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GPRIN2	O60269	458 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ICMT	O60725	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TBX19	O60806	448 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	UBL3	O95164	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	VNN2	O95498	520 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NFATC1	O95644	943 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GAST	P01350	101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PDGFA	P04085	211 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RLN1	P04808	185 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GALT	P07902	379 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ITGB7	P26010	798 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	UQCRC1	P31930	480 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GRK5	P34947	590 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GCGR	P47871	477 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	KCNJ5	P48544	419 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TAS2R38	P59533	333 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	HBA1	P69905	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MGAT3	Q09327	533 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	LMAN2	Q12907	356 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PON3	Q15166	354 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GPR26	Q8NDV2	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MARVELD3	Q96A59	401 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PDXP	Q96GD0	296 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MSANTD3	Q96H12	275 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	WDR81	Q562E7	1941 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CDHR4	A6H8M9	788 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790		H7C2Y5	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TEX28	O15482	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	B3GALT2	O43825	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CLEC3A	O75596	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GPX5	O75715	221 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SLC22A5	O76082	557 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PCDH8	O95206	1070 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR6A2	O95222	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GNRH1	P01148	92 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR12D1	P0DN82	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CD1E	P15812	388 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SLC19A1	P41440	591 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS12	P56730	875 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CTBS	Q01459	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	GALE	Q14376	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	IRF3	Q14653	427 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DECR1	Q16698	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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