RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	PGD	P52209	483 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MAPK12	P53778	367 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FAP	Q12884	760 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	GNA13	Q14344	377 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	GBX1	Q14549	363 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM65	Q6PI78	240 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CNST	Q6PJW8	725 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MED25	Q71SY5	747 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	IFNE	Q86WN2	208 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	RAB43	Q86YS6	212 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MARC2	Q969Z3	335 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	RNF145	Q96MT1	663 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FLNC	Q14315	2725 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	NR5A2	O00482	541 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	KPNA5	O15131	536 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS23	O95084	383 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	MED26	O95402	600 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FOSL1	P15407	271 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CD9	P21926	228 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	UGT2B10	P36537	528 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SLC15A1	P46059	708 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	RFX2	P48378	723 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	GSK3B	P49841	420 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ETV1	P50549	477 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CCL11	P51671	97 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FADD	Q13158	208 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SSPN	Q14714	243 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	FCRL6	Q6DN72	434 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	GLYAT	Q6IB77	296 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF566	Q969W8	418 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	RDH12	Q96NR8	316 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	IP6K3	Q96PC2	410 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	BFAR	Q9NZS9	450 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	USP22	Q9UPT9	525 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FGD4-215	ENST00000551984	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	PTPN13	Q12923	2485 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	CLDN24	A6NM45	220 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	TOR1A	O14656	332 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	TSPAN4	O14817	238 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	DSCR3	O14972	297 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	AKR7A2	O43488	359 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	NPHS1	O60500	1241 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	C1orf105	O95561	183 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	HPR	P00739	348 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	PCNA	P12004	261 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF250	P15622	560 aa		6.08	□□□□□ -1.44
FGD4-215	ENST00000551984	CD36	P16671	472 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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