RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 C3orf14Q9HBI5 128 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PLSCR2Q9NRY7 297 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PNPOQ9NVS9 261 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 HAO1Q9UJM8 370 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPRE3Q9UPY8 281 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FREM3P0C091 2139 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6C70A6NIJ9 312 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC36A6NLP5 189 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ZG16O60844 167 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 UGT2B11O75310 529 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PRPS1L1P21108 318 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MAN2A2P49641 1150 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKAG1P54619 331 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 EFR3AQ14156 821 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PTGR1Q14914 329 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 BICRALQ6AI39 1079 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SZRD1Q7Z422 152 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 HGDQ93099 445 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ARL8AQ96BM9 186 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NODALQ96S42 347 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ADOQ96SZ5 270 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NUF2Q9BZD4 464 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 Q9N2J8 555 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 QPCTLQ9NXS2 382 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KLRF1Q9NZS2 232 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PRB8 838 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 A1L4Q6 167 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHG3P01860 377 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 G6PDP11413 515 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 GP1BBP13224 206 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 GDF1P27539 372 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PNLIPRP2P54317 469 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SNTA1Q13424 505 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM81Q6P7N7 255 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRILQ7L0X0 811 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP43Q8NFH3 380 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35A4Q96G79 324 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ICE1Q9Y2F5 2266 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 FLNCQ14315 2725 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NPIPA2E9PIF3 369 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NPIPA3F8WFD2 350 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 GNB5O14775 395 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 EMC8O43402 210 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SUSD5O60279 629 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPAN2O60636 221 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 HCN1O60741 890 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ICOSLGO75144 302 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAPPC6AO75865 159 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMP1P11279 417 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LBPP18428 481 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK9P50750 372 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN8P56748 225 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PSG6Q00889 435 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MLC1Q15049 377 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TOMM20Q15388 145 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 DECR1Q16698 335 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 DESI1Q6ICB0 168 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CD163Q86VB7 1156 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 OR1J4Q8NGS1 313 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC120Q96HB5 630 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM41AQ96HV5 264 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 EQTNQ9NQ60 294 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ASIC5Q9NY37 505 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CBLCQ9ULV8 474 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MEMO1Q9Y316 297 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 NCKAP5O14513 1909 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GVC2 190 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 OR14I1A6ND48 311 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC3CA6NJW4 275 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 CELA3AP09093 270 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 KITP10721 976 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 GABRA3P34903 492 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SMSP52788 366 aa17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms