RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480158.1

HERC4-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HERC4, Length 2,438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-210ENST00000480158 C1orf21Q9H246 121 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 NDE1Q9NXR1 346 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 RAXQ9Y2V3 346 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 MAN1A2O60476 641 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DNAJA2O60884 412 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 COQ9O75208 318 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DNAJB5O75953 348 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 IGHEP01854 428 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 BCHEP06276 602 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ALOX5P09917 674 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ITGAMP11215 1152 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GPX2P18283 190 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GSK3BP49841 420 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CLCN2P51788 898 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DSTNP60981 165 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 RNF4P78317 190 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 PSG6Q00889 435 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ADRM1Q16186 407 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GPAT3Q53EU6 434 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ASRGL1Q7L266 308 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 RAB43Q86YS6 212 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 COX18Q8N8Q8 333 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 OR2T12Q8NG77 320 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 SFXN5Q8TD22 340 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 FIG4Q92562 907 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 MOAP1Q96BY2 351 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 VMP1Q96GC9 406 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GIN1Q9NXP7 522 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-210ENST00000480158 IGF2RP11717 2491 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-210ENST00000480158 A8MVJ9 347 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-210ENST00000480158 SLC28A2O43868 658 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 FCMRO60667 390 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 OR2J2O76002 312 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 PSMG1O95456 288 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CT45A8P0DMV1 189 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CT45A9P0DMV2 189 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 NR2F1P10589 423 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ITGA3P26006 1051 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ITPKBP27987 946 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GALNSP34059 522 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 KHKP50053 298 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 DCAF10Q5QP82 559 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-210ENST00000480158 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ANKFN1Q8N957 763 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 GATA6Q92908 595 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 ART5Q96L15 291 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 VSTM2LQ96N03 204 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 PRODH2Q9UF12 536 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-210ENST00000480158 MKLN1Q9UL63 735 aa5.95□□□□□ -1.46
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