RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NODAL	Q96S42	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MED12	Q93074	2177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	BCKDK	O14874	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	BIRC5	O15392	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NAGA	P17050	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SOX18	P35713	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SLC1A6	P48664	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	STX3	Q13277	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PGM2	Q96G03	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WV62	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	UPK1A	O00322	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	AQP7	O14520	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SCO2	O43819	266 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SUSD5	O60279	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ICOSLG	O75144	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SLITRK5	O94991	958 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	IGHG3	P01860	377 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HTR1E	P28566	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DCT	P40126	519 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EFR3A	Q14156	821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PTGR1	Q14914	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CEBPE	Q15744	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	RPRML	Q8N4K4	120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	JADE3	Q92613	823 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HGD	Q93099	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ELP4	Q96EB1	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880		Q9N2J8	555 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR14I1	A6ND48	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	T	O15178	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CFLAR	O15519	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HCN1	O60741	890 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ABCB7	O75027	752 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GRK2	P25098	689 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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