RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 WNT4P56705 351 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PSPHP78330 225 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 RPE65Q16518 533 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 COL26A1Q96A83 441 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 MOAP1Q96BY2 351 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 ELP4Q96EB1 424 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 OR2A14Q96R47 310 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 TIGARQ9NQ88 270 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-207ENST00000462494 REV3LO60673 3130 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PRODHO43272 600 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PROM1O43490 865 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 DYRK3O43781 588 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 APODP05090 189 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PTNP21246 168 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CMPK1P30085 196 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IFNGR2P38484 337 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ABATP80404 500 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 EFNB1P98172 346 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRAM2Q15035 370 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 BAK1Q16611 211 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TMCO6Q96DC7 493 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SNTNA6NMZ2 147 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 UBXN7O94888 489 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CA3P07451 260 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MTNR1AP48039 350 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OR2B6P58173 313 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MADCAM1Q13477 382 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AGERQ15109 404 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 UTS2BQ765I0 119 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 KCT2Q8NC54 265 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 HERVK_113Q902F9 699 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FGF11Q92914 225 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TM9SF2Q99805 663 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ABCB9Q9NP78 766 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GDE1Q9NZC3 331 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RFXAPO00287 272 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC31A1O15431 190 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FCMRO60667 390 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CCNKO75909 580 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SDC2P34741 201 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IGFALSP35858 605 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GAS1P54826 345 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 DAB2P98082 770 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ST3GAL3Q11203 375 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RAB40BQ12829 278 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TAB1Q15750 504 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZNF79Q15937 498 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MTSS1LQ765P7 747 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TM9SF4Q92544 642 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 KXD1Q9BQD3 176 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MSL3P1P0C860 447 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GNSP15586 552 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IFNA8P32881 189 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NR4A2P43354 598 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PDX1P52945 283 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TSPAN31Q12999 210 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PIGXQ8TBF5 258 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms