RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 C6orf89Q6UWU4 347 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MACC1Q6ZN28 852 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYS1Q717R9 158 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPBQ8NG41 125 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4K1Q8NGD4 311 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 STYXQ8WUJ0 223 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSMEM1Q8WWF3 244 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2A5Q96R48 311 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 FNDC11Q9BVV2 318 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCAR1Q9BXC0 346 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB34Q9BZG1 259 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG9Q9H6U8 611 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALHM2Q9HA72 323 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL1RL2Q9HB29 575 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMACRQ9UHK6 382 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC7Q9UPT5 735 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGPT4Q9Y264 503 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOCK6Q96HP0 2047 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANK2Q01484 3957 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0A6YYD4 124 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM120BA0PK00 339 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBAL3A6NHL2 446 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 D6RAR5 112 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL24O00175 119 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PEX12O00623 359 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 KPNA5O15131 536 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOL4O94818 638 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBED1O96006 694 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 URODP06132 367 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASGR1P07306 291 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFN1P07737 140 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSM4P0C7M7 580 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM18P0DKX4 95 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GZMHP20718 246 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCB4P21439 1286 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALML3P27482 149 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPDP32754 393 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA8P43361 318 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA12P43365 314 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CX3CR1P49238 355 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ESRRGP62508 458 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP1B1Q10567 949 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC12A1Q13621 1099 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRB14Q14449 540 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZIC1Q15915 447 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTXN3Q4LDR2 81 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN12Q6JVE5 192 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 UFSP1Q6NVU6 142 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHST9Q7L1S5 443 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT74Q7RTS7 529 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRLQ86TD4 932 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 VSTM4Q8IW00 320 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH26Q8IXH8 852 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIMKLAQ8IXN7 391 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCOLN2Q8IZK6 566 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM252Q8N6L7 170 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM105Q8N8V8 129 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM184AQ8NB25 1140 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 IPMKQ8NFU5 416 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA1Q92805 767 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHMP4CQ96CF2 233 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP16Q9BY84 665 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 WWP1Q9H0M0 922 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRF2Q9HAW0 419 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC1Q9NV70 894 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIDEBQ9UHD4 219 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTTNQ86VV8 2226 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNS2Q63HR2 1409 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDS5BQ9NTI5 1447 aa-1.63□□□□□ -2.67
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