RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MEGF11A6BM72 1044 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 BRINP1O60477 761 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN8P56748 225 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 NFATC2Q13469 925 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 RAB11BQ15907 218 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PROX2Q3B8N5 592 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 AGAP6Q5VW22 663 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 KANK2Q63ZY3 851 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 FAM46BQ96A09 425 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 AGAP4Q96P64 663 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR14A2Q96R54 314 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GJD2Q9UKL4 321 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 EMCNQ9ULC0 261 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 DHDHQ9UQ10 334 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 A6NLC8 198 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SOBPA7XYQ1 873 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 H7BY64 318 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PPP6CO00743 305 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SSX5O60225 188 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GPR37L1O60883 481 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 APBB3O95704 486 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 BEST3Q8N1M1 668 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 NAXEQ8NCW5 288 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T33Q8NG76 320 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 IGSF8Q969P0 613 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SCLYQ96I15 445 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 VAPAQ9P0L0 249 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 CTDSP2O14595 271 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 RETP07949 1114 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 RAC2P15153 192 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GGT2P36268 569 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 CDK3Q00526 305 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 BCL7AQ4VC05 210 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 LILRA2Q8N149 483 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 THAP4Q8WY91 577 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf72A6NCS6 295 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 RHCEP18577 417 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 SOX3P41225 446 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 PKDCCQ504Y2 493 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PGAM5Q96HS1 289 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A7Q99884 636 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GNG13Q9P2W3 67 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PCTPQ9UKL6 214 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 LAMB1P07942 1786 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ARPC5O15511 151 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 JMJD7P0C870 316 aa8.43□□□□□ -1.06
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