RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SDF2Q99470 211 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 WDR45Q9Y484 360 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PCDH17O14917 1159 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 UGT2B17O75795 530 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 NKX2-2O95096 273 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CRHBPP24387 322 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 IFNA8P32881 189 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PDX1P52945 283 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ESRRGP62508 458 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 IL1RL1Q01638 556 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 TEKQ02763 1124 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CDK5R2Q13319 367 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 RAPSNQ13702 412 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 GANABQ14697 944 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 HLA-BQ31612 363 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 AMZ1Q400G9 498 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 EIPR1Q53HC9 387 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 MLIPQ5VWP3 458 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF773Q6PK81 442 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DEF8Q6ZN54 512 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 RIT1Q92963 219 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FUZQ9BT04 418 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FANCEQ9HB96 536 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 KLHL3Q9UH77 587 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 NINQ8N4C6 2090 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SEMA7AO75326 666 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 EPPINO95925 133 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CBX7O95931 251 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CT62P0C5K7 136 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 S1PR1P21453 382 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CSF2RBP32927 897 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 TTKP33981 857 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 NADK2Q4G0N4 442 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SATL1Q86VE3 508 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 GPR135Q8IZ08 494 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 COX18Q8N8Q8 333 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PIGKQ92643 395 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 NAT6Q93015 286 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DGAT2Q96PD7 388 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 AGAP5A6NIR3 686 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 FCMRO60667 390 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ELK4P28324 431 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 IL5RAQ01344 420 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 MEP1AQ16819 746 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 PROX2Q3B8N5 592 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DCST2Q5T1A1 773 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 BROXQ5VW32 411 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 LACC1Q8IV20 430 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 NDC1Q9BTX1 674 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ARMC7Q9H6L4 198 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-202ENST00000338546 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms